Chương trình đào tạo nghề của trường Hoa Sữa bao gồm 3 hệ đào tạo từ thấp đến cao (sơ cấp nghề, trung cấp nghề, trung cấp chuyên nghiệp). Nội dung đào tạo xây dựng dựa trên những nguyên lý giáo dục của Việt Nam, kết hợp với các kỹ năng nghề quốc tế. Ngoài ra, ba nghề: nấu ăn Âu, bánh mỳ - bánh ngọt và phục vụ bàn được cấp bằng nghề hỗn hợp Việt -  Pháp. Ở hệ sơ cấp nghề có đào tạo kỹ thuật cắt may, thêu cho mọi đối tượng có nhu cầu, đặc biệt chú ý đến học sinh khiếm thính và khuyết tật vận động nhẹ. Hai phần ba thời gian đào tạo dành cho thực hành với một hệ thống các địa điểm thực hành. Đội ngũ giáo viên thường xuyên tham gia các khóa bồi dưỡng trong nước và quốc tế nhằm xây dựng giáo trình hoàn chỉnh, phù hợp với tiêu chuẩn nghề quốc gia và quốc tế. Trường cũng thường xuyên duy trì mối quan hệ hợp tác chặt chẽ với doanh nghiệp hoạt động trong các lĩnh vực liên quan. Doanh nghiệp hỗ trợ trường Hoa Sữa hoàn thiện chương trình đào tạo, tham gia các kỳ thi đánh giá, sắp xếp thực tập và nhận học sinh sau khi tốt nghiệp.
 

Bên cạnh hoạt động tự chủ, trường Hoa Sữa cũng nhận được sự hỗ trợ từ các đối tác trong nước và quốc tế trong việc xây dựng hệ thống cơ sở vật chất, đào tạo nghề và bồi dưỡng nâng cao chất lượng giáo viên.
Năm 1997 - 1998, trường Hoa Sữa được chương trình hỗ trợ phát triển Liên hợp quốc (UNDP) và Tổ chức công giáo chống đói nghèo và vì sự phát triển (CCFD - Pháp) giúp trang thiết bị thực hành, lương cho một số giáo viên và tình nguyện viên. Giai đoạn này trường thành lập tổ dạy may - thêu cho đối tượng thanh niên khuyết tật cũng như xây dựng bộ từ điển ký hiệu dùng cho nghề may, thêu, vẽ và có được sự hợp tác hỗ trợ đào tạo từ Trường Gille Jamain dạy nghề may thêu cao cấp - Pháp. Giai đoạn 1999 - 2001, trường Hoa Sữa được nhà nước cấp 2.022m2 đất tại Lĩnh Nam (Thanh Trì, Hà Nội). Trường xây dựng khu nội trú cho học viên do Quỹ phát triển văn hóa xã hội - Đại sứ quán Tây Ban Nha và khu đào tạo thực hành nghề nhà hàng, khách sạn do Tổ chức CCFD và Bộ ngoại giao Pháp tài trợ. Nữ hoàng Tây Ban Nha Sophia tới thăm trường Hoa Sữa, xúc động trước hoạt động đào tạo từ thiện của trường, đã đề nghị Tây Ban Nha tiếp tục giúp xây dựng trung tâm đào tạo nghề may thêu cho người khuyết tật. Ngày 12/12/2005, Thủ tướng Pháp Dominique Villepin trao tặng trường giải thưởng Nhân quyền của Uỷ ban quốc gia Pháp vì những đóng góp với xã hội.
17 năm qua, trường Hoa Sữa đào tạo được 7000 thanh niên có hoàn cảnh khó khăn, tạo việc làm ổn định và hòa nhập xã hội. Địa điểm tuyển sinh ngày càng mở rộng theo nhu cầu của những thanh niên nghèo từ các thành phố lớn như Hà Nội, Huế, Đà Nẵng, Nha Trang... đến các tỉnh, các vùng miền xa xôi như Điện Biên, Cao Bằng, Lào Cai, Quảng Nam, Lâm Đồng, Đắc Lắc, Ninh Thuận, Kiên Giang... Đối tượng tuyển sinh cũng được mở rộng: dân tộc thiểu số, người nghèo ở các khu du lịch cộng đồng, dân chài tại các dự án bảo tồn biển, phụ nữ bị buôn bán, con em nạn nhân thiên tai... với các chương trình đào tạo riêng phù hợp cho từng đối tượng.
Tháng 10/2005, trường Hoa Sữa trở thành trung tâm đào tạo và thẩm định nghề nhà hàng - khách sạn trong khuôn khổ dự án "Phát triển nguồn nhân lực du lịch Việt Nam" của Tổng cục Du lịch Việt Nam và Liên minh Châu Âu (EU). Tháng 3/2006, trường được cấp chứng chỉ ISO 9001 - 2000 về quản lý chất lượng. Hiện nay có 800 học sinh đang học trong khóa đào tạo mới, số lượng học sinh tốt nghiệp hàng năm của trường Hoa Sữa không đủ đáp ứng nhu cầu tuyển dụng của doanh nghiệp khối nhà hàng - khách sạn. Hiện 100% học sinh tốt nghiệp được sắp xếp việc làm. Thành công lớn nhất của trường Hoa Sữa chính là sự thay đổi nhận thức của các đối tượng tham gia các chương trình đào tạo, mang lại sự kết hợp hiệu quả giữa nhà trường - chính quyền và các doanh nghiệp./.